Od 16 października 2007 r. toruńskie V Liceum Ogólnokształcące nosi imię Jana Pawła II. Uroczystość nadania szkole patrona i sztandaru odbyła się w rocznicę wyboru kardynała Wojtyły na Papieża.
V Liceum Ogólnokształcące to jedna z najlepszych szkół w Toruniu, wysoko lokowana w ogólnopolskich rankingach szkół średnich – w 2005 r. na 50 pozycji. Przyjmując za patrona Jana Pawła II liceum dołączyło do grona 800 szkół w Polsce noszących to zaszczytne imię.
Decyzję o nadaniu V LO imienia Ojca Świętego Jana Pawła II Rada Miasta Torunia przyjęła w dniu 26 kwietnia 2007 roku. Oficjalne przekazanie szkole uchwały oraz sztandaru z imieniem patrona odbyło się 16 października 2007 r. - w rocznicę pamiętnego dnia 1978 roku, kiedy z watykańskiego balkonu rozległo się słynne Habemus papam, obwieszczające wybór Karola Wojtyły na Papieża.
Uroczystość rozpoczęła się Mszą Świętą w kościele pw. św. Józefa oraz poświęceniem sztandaru szkoły przez ks. Biskupa Andrzeja Suskiego. Potem obchody przeniosły się do auli V LO. Wzięli w nich udział przedstawiciele samorządu toruńskiego: prezydent Torunia Michał Zaleski, przewodniczący Rady Miasta Torunia Waldemar Przybyszewski, zastępca prezydenta Torunia Zbigniew Fiderewicz, wiceprzewodniczący Rady Miasta Torunia Andrzej Jasiński i przewodniczący Komisji Oświaty, Polityki Społecznej i Bezpieczeństwa RMT Zbigniew Ernest.
- V Liceum Ogólnokształcące to szkoła, na której Toruń się nigdy nie zawiódł – pierwsze słowa przemówienia prezydenta Torunia Michała Zaleskiego społeczność szkolna nagrodziła burzą oklasków.
Z okazji przyjęcia nowego imienia szkoła otrzymała od toruńskiego samorządu pamiątkowe obrazy: od przewodniczącego Rady Miasta Waldemara Przybyszewskiego akwarelę z wizerunkiem Ojca Św. autorstwa Edwarda Jonatowskiego, od prezydenta Torunia - akwafortę „Madonny” Krystyny Szalewskiej.