Muzeum Okręgowe w Toruniu znalazło się na 9. miejscu wśród muzeów z najwyższą frekwencją w Polsce. Takie dane przyniósł raport „Statystyka muzeów” za rok 2017, opublikowany przez Narodowy Instytut Muzealnictwa i Ochrony Zabytków (NIMOZ) .
Toruńską instytucję odwiedziło dokładnie 396 505 osób i to mimo wyłączonego z użytku przez kilka miesięcy modernizowanego Domu Mikołaja Kopernika.
Poniżej ranking frekwencji muzeów w Polsce za rok 2017 (wg NIMOZ):
1. Muzeum Żup Krakowskich Wieliczka 1 574 744
2. Muzeum Historyczne Miasta Krakowa 1 282 373
3. Muzeum Łazienki Królewskie w Warszawie 728 600 / 3 000 000 (łącznie z parkiem)
4. Muzeum Zamkowe w Malborku 643 691
5. Muzeum Narodowe we Wrocławiu 605 259
6. Zamek Królewski w Warszawie 602 095
7. Narodowe Muzeum Morskie w Gdańsku 469 836
8. Muzeum – Zamek w Łańcucie 438 604
9. Muzeum Okręgowe w Toruniu 396 505
Muzeum Okręgowe w Toruniu ma obecnie 8 oddziałów. Są to:
Ratusz Staromiejski, Dom Mikołaja Kopernika, Muzeum Historii Torunia (Dom Eskenów), Muzeum Sztuki Dalekiego Wschodu (Kamienica Pod Gwiazdą), Muzeum Podróżników im. T.Halika, Muzeum Toruńskiego Piernika, Biblioteka Naukowa i najnowsze - Muzeum Twierdzy Toruń, którego otwarcie zaplanowano w 2020 r.